Налоговый кодекс относит доходы иностранной организацией от международных перевозок (если оно не связано с предпринимательской деятельностью через постоянное представительство в РФ) к доходам от источников в Российской Федерации и подлежат обложению налогом на прибыль, удерживаемым у источника выплаты такого дохода.
Но если перевозка осуществляется исключительно между пунктами за пределами России, то она не рассматривается в налоговом учете как международная. Доходы иностранной организации-перевозчика, соответственно, не относятся к доходам от источников в РФ и потому не подпадают под налогообложение в РФ (письмо Минфина №03-08-05/1 от 5 марта 2010 года).
По материалам "Российский налоговый портал"